L’assemblée générale du Centre Marocain de Recherches Polytechniques et d’Innovation  est l’instance suprême et  décisionnelle du Centre, il est composé de tous les membres actifs affiliés aux CMRPI.

Selon l’article 9  et 10 du statut du CMRPI, l’assemblée générale du Centre détermine et adopte la vision globale du CMRPI, l’adoption du rapport moral et financier du centre et élut son conseil administratif.

L’assemblée générale ordinaire se réunit chaque quatre an, alors que dans des cas exceptionnels, le président du centre ou deux tiers des membres actifs peuvent appeler à une assemblée générale extraordinaire  pour répondre à un besoin critique et urgent du centre.